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新冠(SARS-II型病毒)中国疫情简史(二)

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发表于 2020-4-24 09:12:19 | 显示全部楼层 |阅读模式
上一篇:新冠(SARS-II型病毒)中国疫情简史(一)下

(二)

1月1日

1月1日凌晨,武汉市中心医院后湖院区急诊科又收到一位由武汉市红十字会医院转入的65岁男子。该男子在华南海鲜市场附近开诊所,最近收治了很多发热病人,之后自己也有了症状,病情严重。急诊科主任艾芬判断,这位诊所老板很可能就是被其诊所的病人传染的。

这是又一个人传人的警兆。至此,已经出现的人传人信号有:
1. 27、28两日中西医结合医院呼吸与重症医学科接诊的一家三口病例;
2. 27日中午,广州微远基因电话通知中心医院24日送检样本基因测序结果,称发现一种“Bat SARS like”的新冠状病毒;
3. 中心医院急诊科12月29日前接诊的母子病例;
4. 12月30日下午,北京博奥医学检验所致中心医院的检测报告(27日采自陈姓会计的送检样本),显示检出(类)“SARS冠状病毒”;
5. 1月1日凌晨,中心医院急诊科接诊的诊所老板病例。

艾芬医生再次联系医院公共卫生科和医务处,报告了上述病例,同时报告了该患者最近曾收治很多发热病人这一情况,希望能够引起重视。艾芬担心,“一旦急诊科医生或者护士被感染得病,就很麻烦了”。但中心医院领导并未作出相应的防范安排,在‘反映情况无果后’,当天,艾芬要求急诊科的200多名医护人员加强防护,所有人必须戴N95口罩,戴帽子,用手快消。
(资料来源:《中国新闻周刊》、《人物》)

尽管武汉卫健委12月31日情况通报称‘未发现明显人传人现象’,但不少医务人员已警觉到“不明原因肺炎”的明显人传人迹象,包括艾芬医生,包括“吹哨人”们,包括张继先医生,其它一些医生也加强了个人和本部门的防范。1月初,“人传人”的猜测也在金银潭医院流传,医院‘ICU主任吴文娟再三向科室强调,一定要做好自我防护’。明确意识到“不明原因肺炎”“人传人”的,还有第五医院消化内科主任吕小红医生。稍后1月2日的内容将再谈到吕小红医生。

1日清晨5点多,华南海鲜市场贴出了休市整治的公告,不过,众多商户仍陆续开铺营业。7点多,身穿白色防化服的消毒人员出现在市场,城管也在市场的各个出入口站岗,设置路障。在工作人员催促下,商家纷纷收拾铺面,至8时左右,大都闭店离开。




华南海鲜市场分东、西两个区域,共有摊位600余个,从业人员超过1000。据财新记者报道,此次患者主要分布在西区摊位,但东区也受到了影响。

华南海鲜市场距汉口火车站不足一公里,距优抚医院200米,市场西区南距一路之隔的武汉市疾控中心280米,疾控中心则南邻武汉协和医院。该海鲜市场与武汉病毒研究所直线距离12公里,最短行车路线里程不超过23公里。

1月1日,国家卫健委“成立以马晓伟主任为组长的疫情应对处置领导小组,会商分析疫情发展变化,研究部署防控策略措施,及时指导、支持湖北省和武汉市开展病例救治、疫情防控和应急处置等工作’。领导小组规定每日召开疫情应对会议。”。这一情况是1月19日晚对外公布的。

发热患者自1月1日起明显增多。中国新闻周刊《亲历者讲述:武汉市中心医院医护人员被感染始末》一文报道说,1月1日后,武汉市中心医院接收到的发热患者愈发增多,像‘火山喷发’一样,艾芬医生的急诊科在1月的第一周,将后湖院区急诊外科病房改造成呼吸科隔离病房,有20张左右的床位。

武汉许多医院都出现了类似情况。在财新网文章《武汉围城》中,武汉协和医院感染科主任医师赵雷说,自2019年12月底以来,涌入协和医院的发热病人越来越多,最高时一天达八九百人。12月31日,之前没有呼吸道传染病房的协和医院把单独一栋五层病房楼的整个一层改成了24个床位的呼吸道传染病隔离病区。24张床很快被填满,隔离病区又扩大到二层,然后还是不够,三层、四层也很快被腾空,原有的重症病人都被集中到了五层。近30名感染科医生已经不够用了,医院动员了全院资源,尤其是呼吸科和急诊科的内科医生来轮班,护士也是全院调配。

南方周末《“重组”金银潭:疫情暴风眼的秘密》一文也报道说,(因患者明显增多),从1月1日起,金银潭医院(即武汉市传染病医院)专门设立了‘不明原因肺炎’各级专家(每日)值班会诊,为支援金银潭医院,武汉市卫健委特地抽调了武汉市第二医院(中心医院)、第三医院、第四医院、武昌医院等医院的医务人员,前来充实会诊专家队伍。

以下是三个截止1月1日的病例数参考数据。

1月29日,中疾控冯子健、湖北省疾控中心杨波等人在国际顶级期刊《新英格兰医学杂志》上发表了一篇论文,名为“新型冠状病毒感染性肺炎在武汉的早期传播动态”,论文中采用的病例样本数据表明,至1月1日,武汉已至少有45例不明肺炎患者。

2月12日,中国疾控中心新冠肺炎应急响应机制流行病学组在《中华流行病学杂志》上投稿了一篇论文,题为《新型冠状病毒肺炎流行病学特征分析》,论文对截至2020年2月11日中国内地报告的所有病例进行了流行病学特征描述和分析,披露了很多关键数据。论文中的数据显示,按照发病日统计,2019年12月31日前有感染者104人,这些人中有15人(后来)死亡。(相关数据可见于下图二)


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图一


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图二

3月13日,《南华早报》称,一份该报获得的政府内部数据显示:11月即报告9例病例,12月15日病例为27人,突破两位数,12月20日有60例,12月31日达266例,2020年1月1号增加到381例。

1月1日,新冠第一版诊疗方案《不明原因的病毒性肺炎诊疗方案(试行版)》‘紧急完成’。该方案由国家专家组成员,呼吸与危重症医学专家、中日友好医院副院长曹彬执笔,‘汇集了所有最初参与患者救治(的)专家的贡献’。‘鉴于当时疫情主要集中在武汉市,第一版诊疗方案写成后并未对全国印发,重点印发至武汉市各级医疗卫生机构’。

12月30日晚自金银潭医院、武汉疾控中心拿到病毒样本后,1月1日,中科院武汉病毒研究所进行了病毒分离工作(这应该是基因测序前的一项准备工作,不等于分离出病毒毒株,因为病毒所5日才分离得到病毒毒株)。

财新网2月27日的长篇调查 “新冠病毒基因测序溯源:警报是何时拉响的”中说,“一位基因测序公司人士透露,2020年1月1日,他接到湖北省卫健委一位官员电话,通知他武汉如有新冠肺炎的病例样本送检,不能再检;已有的病例样本必须销毁,不能对外透露样本信息,不能对外发布相关论文和相关数据,‘如果你们在日后检测到了,一定要向我们报告’”。

1日傍晚,武汉市公安局官方微博发布消息称,针对(不明)肺炎病例,武汉市卫健委(已)就此发布情况通报,但一些网民不经核实,发布、转发不实信息,已传唤、处理8人。



一般认为,被传唤、处理的8位市民包括(华中科技大学同济医学院附属)协和医院肿瘤中心主治医师谢琳卡(被电话问询),武汉红十字会医院神经内科医生刘文(2日前后被传唤,签笔录),1月3日被训诫的李文亮医生是否也属于这8人,有不同说法。财新网报道说,‘这八名「违法」网民,事后证明多为医生’。另有媒体披露,这8位吹哨者分别来自三个微信群:武汉大学临床04级群(李文亮医生所在群)、协和红会神内群(刘文医生所在群)、肿瘤中心群(谢琳卡医生所在群),这三个群都是医学交流群。

1日晚11点46分,市中心医院监察科科长给艾芬医生发了条消息,要她第二天早上过去一趟。


1月2日


据《财新》报道,1月2日,大量环卫工人在华南海鲜市场进行清洁作业,市场门口沿街排水沟渠的污泥被挖出,身着防化服的人员在市场各处采样。西区七街附近是消毒重点区域,检疫人员对每个门面逐一搜集、提取检测物质。

2日早上8点多一点,艾芬还没交完班,院监察科催她过去的电话就又打过来了。

在之后的约谈中,艾芬‘遭受了前所未有的、非常严厉的斥责’。谈话的领导(党委书记蔡莉等)说,‘我们出去开会都抬不起头,某某某主任批评我们医院那个艾芬,作为武汉市中心医院急诊科主任,你是专业人士,怎么能够没有原则没有组织纪律造谣生事?’;艾芬医生被训斥时,很多人在场,听到院领导还使用了三个排比句。这三顶在公开报道中被隐去的政治大帽子是:“你视武汉市自军运会以来的城建结果于不顾,你是影响武汉安定团结的罪人,你是破坏武汉市向前发展的元凶!”

遭到如此非难,艾芬不由得激动地回应,‘这个事是我做的,跟其余人都没有关系,你们干脆把我抓去坐牢吧’。艾芬提出,‘我现在这个状态不适合在这个岗位上继续工作了,想要休息一段时间。’,领导没有同意,领导说,这个时候,正是考验你(艾芬)的时候。

领导还指示艾芬,‘回去跟科室的200多号人一个个地口头传达到位,不能发微信、短信传达,只能当面聊或者打电话,不许说关于这个肺炎的任何事情,「连自己的老公都不能说」……’

艾芬再次提醒领导,这个病可以人传人,领导未置可否(‘但没有获得任何回应’)。

2日当天,中心医院通知本院员工,医务人员之间不许公开谈论病情,不得通过文字、图片等可能留存证据的方式谈论病情,病情只能在交接班必要的时候口头提及。中心医院的医生、护士,只好隐晦地提醒身边亲友,要戴口罩;对于前来就诊的患者,医生们则讳莫如深。

华中科技大学同济医学院附属协和医院的相关情况如同中心医院的翻版。协和医院的一位医生林羽(化名)在接受《中国新闻周刊》采访时回忆说,疫情刚开始的时候,武汉市的策略都是 “冷处理”。他所在的医院通知,没有单位授权,不允许私自在公众平台谈论病情,不允许私自接受媒体采访;不仅仅是临床系统,院感、CDC那边消息管控更严重,“整个就不让说”。当时,医生们唯一能做的,就是一再嘱咐就诊患者 “口罩、口罩、一定要买口罩、戴口罩”,甚至半开玩笑地嘱咐 “不要去华南海鲜市场买东西,那里东西不新鲜”。
(注:以上七段内容参考了《人物》、《南方周末》、《中国新闻周刊》等的相关报道)

自金银潭医院1日设立‘不明原因肺炎’专家值班会诊后,2日,武汉市第五医院也开设了专门的发热门诊。

《澎湃新闻》有一篇对第五医院消化内科主任吕小红的专访,专访中,吕小红医生有如下叙述:“2019年12月25日前后,我就听说武汉市两家医院有医护人员疑似感染不明原因的病毒性肺炎,并被隔离,其中还有呼吸科的医护人员。我当时就意识到,情况可能不简单。内科,尤其是呼吸科的。。。他们本身就是医护人员里面最谨慎、最会保护自己的。连他们都被感染了,说明传染性可能很强。”

“后来我越想越觉得不对劲,到了2020年1月2日下午参加医院述职会时,我忍不住和院领导提建议,是不是要把发热门诊正式开起来,建立规范的检疫、导诊程序。本来流感季也到了,急诊压力很大。领导当场就同意了。”

吕小红医生还介绍说,“之前,发热门诊是挂靠在感染科门诊下的,病人之间很可能交叉感染。据我了解,武汉市不单独开设发热门诊的医院不在少数,因为发热门诊、感染科门诊都没什么利润。第二天下午,医院就接到了上级要求,不仅要设置发热门诊,还要开设发热病房,收治患有不明原因肺炎的病人。”

1月2日11:40,CCTV13播放了武汉市“8名散布(肺炎疫情)谣言者被查处”的新闻。当天,中国多个电视台的多个电视频道播放了这一新闻。



财新网报道,可能是被查处8人之一的武汉红十字会医院神经内科医生刘文,1月2日前后“被警方电话通知叫去了派出所,警察向他询问了消息来源、事情经过,并形成了书面笔录,而后根据警方要求逐页签字并按下手印。刘文称警方没有特意为难他,都是按流程办事。。。”之前的12月31日,刘文还被医院相关部门约谈,询问消息来源。

1月2日中午12点,中国疾控中心病毒所收到湖北省疾控中心送检的4例不明原因病毒性肺炎病例标本,这是中国疾控中心第一次得到来自武汉的不明肺炎病例标本。在此之前,几家民营公司(广州微远、北京博奥、华大基因),上海市公共卫生临床中心,武汉市疾控中心,武汉病毒研究所等公司、机构都已先行得到了采集自武汉医院的病例标本。

经过‘连续72小时攻关’,继1日进行病毒分离(不等于分离出病毒毒株)后,中科院武汉病毒研究所于1月2日就完成了病毒的基因测序,确定了新冠病毒的全基因组序列,证实是一种‘全新’的冠状病毒。不过,这一成果1月11日才提交至GISAID(全球共享流感病毒数据库),直到2月4日才正式对外公布。

基因测序委托行业的“龙头老大”--华大基因的工作与武汉病毒研究所大致同步。华大基因与武汉当地医院有着常年合作关系,据财新记者调查,2019年12月26日,华大基因即从武汉当地医院收到一份不明肺炎病例样本,19年12月,武汉当地医院给华大基因发送了超过30例疑难肺炎的病例样本,委托其测序。华大在这些样本中发现了三例新冠病毒感染样本,这三例样本分别收样于12月26日,12月29日和30日。12月29日,华大基因对26日病例样本中的病毒作了基因测序,结果显示,与SARS基因序列相似度高达80%,但不是SARS,是一种之前未发现过的冠状病毒。华大基因用他们的SARS检测试剂盒对病例样本进行了检测,结果呈阴性(注:12月30日夜,武汉病毒所检测的7例金银潭病例样本中,2例SARS冠状病毒检测结果为阳性)。华大还将三例类SARS冠状病毒混装,用三个病毒基因序列片段合成了一个混装的病毒基因序列。1月1日,华大将三份样本的检测报告上报武汉市卫健委。1月3日,华大基因对三个样本中的病毒都进行了高深度的全基因序列测序。

还有人走在武汉病毒所和华大基因的前面。财新网2月27日刊出的长篇调查 “新冠病毒基因测序溯源:警报是何时拉响的”还披露,一家位于广州黄埔的民营企业(应该就是广州微远基因)‘实验室组装出了接近完整的病毒基因组序列,数据同时也共享给了中国医学科学院病原所’,该公司的一名员工,微信公号为“小山狗”,于1月28日发布过的一篇文章,题为“记录一下首次发现新型冠状病毒的经历”。文章中说,“基本可以确认这个患者的样本里面确实有一个跟Bat SARS like coronavirus类似的新型病毒。”,“中午前已经跟医生沟通了,患者也隔离了”(27日广州微远电话曾通知武汉中心医院,发现一种新的冠状病毒)。

文中还称,“应该就是我们首次发现了这个新型冠状病毒吧”,并贴出了GISAID数据库的截图予以佐证,“从GISAID数据库网站上提交的数据来看,样本收集时间最早的也是我们。”

财新记者核查发现,GISAIDS上,样本采集时间最早的一条新冠病毒基因序列是在2019年12月24日采集(采集的就是12月16日就诊中心医院的65岁送货员的肺泡灌洗液样本,该患者后来在金银潭医院不治身亡),并由中国医学科学院病原所于1月11日上传的。比对编号、名称等可发现,这就是“小山狗”截图中标记出来的他们公司参与检测的样本序列。

文章还提及,12月27日、28日该公司领导跟医院、疾控(部门)电话沟通,29日、30日甚至亲自去武汉跟医院、疾控中心领导当面汇报交流所有分析结果,“包括所有我们的分析结果以及医学科学院病原所的分析结果。一切都在紧张、保密、严格的调查中”,“此时医院和疾控的人早已经知道有多名类似患者,我们沟通了检测结果之后已经开始了应急处理”。

(注:
最早上传新冠病毒基因序列至GISAIDS,并通过GISAID、virological.org和GenBank向世界公布、共享基因序列的是复旦大学附属上海市公共卫生临床中心张永振团队,上传时间是1月11日上午9时。当晚,国家卫健委(被迫)宣布,中国将与世卫组织分享新冠病毒基因序列信息。随即,国家卫健委领导的小组在GISAID上发布了另外5个来自不同患者的病毒基因组序列。这5个基因序列来自三个机构:中国疾控中心、中国医学科学院(广州微远基因合作方)、中科院,5个基因序列中,有一个是中科院武汉病毒研究所1月2日确定,1月11日上传至GISAID的。
1月12日,首先向世界公开、共享新冠病毒基因序列的上海市公共卫生临床中心实验室,在共享新冠基因序列的次日被上海市卫健委勒令关闭,进行整改。
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